不同病因导致的肠胃炎症状不同，常常可出现腹痛、腹泻、腹胀、餐后饱胀及早饱感、食欲减退、嗳气、反酸、恶心等症状，腹泻、呕吐严重者可出现脱水以及电解质紊乱的表现。急性应激或药物所致的胃肠炎，还可出现呕血、黑便等。
对感染性的胃肠炎，多急性起病，还可以伴有乏力、排稀水样便等症状。食物中毒者多在进食后几个小时发病严重，严重者可出现黏液样脓血便。还有非感染性肠胃炎患者，无症状或者症状不明显，或者是非特异性的消化不良，比如上腹痛、腹胀、餐后饱胀等。此外，也可以食欲减退、嗳气、反酸，严重者也可出现呕血以及黑便。