婴儿肝损伤的原因通常有以下几个方面：第一，比较常见的就是药物性的肝损伤；第二，婴儿期器官功能发育不成熟，肝脏比较娇嫩，常见的病毒细菌感染，如果没有得到有效的控制，病情加重的话，就会导致肝损伤；第三，嗜肝病毒感染是引起婴儿肝损伤的常见原因，比如巨细胞病毒感染、EB病毒感染、Torch感染或甲、乙、丙、丁、戊肝肝炎病毒感染等；第四，遗传代谢性疾病也可以导致肝损伤，如肝糖原贮积症、希特林蛋白缺乏症等。