尿路结石在男性和女性当中的临床表现并无区别，尿路结石的主要临床表现为当结石位于肾盂腔内时，多数无临床症状或仅伴有轻微的钝痛、隐痛症状。当结石向外溢出进入输尿管内形成输尿管结石，患者可出现突然发作的脊肋角和腰部的刀割样疼痛，常伴有放射痛，受累部位为同侧的下腹部腹股沟股内侧，男性可放射至睾丸和阴茎口，女性可放射至阴唇。
血尿是肾结石的另外一个常见临床症状常常在腰痛后发生，血尿产生的原因是结石移动或者患者剧烈运动，导致结石对集合系统的损伤。当输尿管结石发作时，输尿管腔内压升高，由于输尿管和肠道有共同的神经支配，可引起患者的恶心、呕吐症状。
对于肾绞痛发作时可能伴有或者不伴有低热，由于结石梗阻和感染可以相互促进，肾结石造成的梗阻可继发或加重感染，出现腰痛伴高热、寒战等，其它症状比如还存在无尿或者急性肾功能不全、肾积水和慢性肾功能不全的症状。