先天性后尿道瘘的症状相对典型，表现为肛门直肠闭锁、排尿时尿道排气、尿液浑浊、混有胎便等，行相关检查之后可见尿道与直肠相通，并发瘘孔等，为本病的典型症状。
一、典型症状
1、肛门直肠闭锁：是本病的主要症状表现，先天性的尿道畸形可引起肛门直肠的闭锁症状，需及时手术治疗。
2、排尿时尿道排气：是本病症状之一，主要是由于尿道与直肠的相通，导致肠内的空气进入尿道，而发生排尿时的尿道排气症状。
3、尿液浑浊：主要由于并发尿路感染、肾盂肾炎等疾病，而导致尿液较为浑浊。
4、混有胎便：与排尿时尿道排气的症状相通，主要原因是直肠与尿道相通，部分胎便可通过瘘孔进入尿道，则表现为尿液中混有胎便。
二、其他症状
尿道与直肠相通，可发生尿液经瘘孔进入直肠，与肠内的物质产生反应，而导致血液中的氯上升，则表现为高氯性酸中毒。