抑制胃酸的药物主要有H2受体拮抗剂，如雷尼替丁，以及质子泵抑制剂，即PPI，如奥美拉唑。H2受体拮抗剂在治疗消化性溃疡中是一类主要的药物，疗效好、用药方便，长期使用不良反应少。PPI跟H-K-ATP酶结合以后，其作用是不可逆的。治疗胃和十二指肠球部溃疡，需要6周时间，愈合率分别为80%-95%和90%-95%。
在治疗胃和十二指肠球部溃疡时需要4周，愈合率可以达到90%-100%。PPI还可以增强抗幽门螺杆菌的抗生素的杀菌作用。