对于急性便秘要根据不同的病因选择不同的治疗方法，临床主要应用药物治疗及手术治疗，如排除肠道机械性梗阻病因后可酌情应用导泻药物；情绪抑郁者可口服抗抑郁药物治疗等。
一、病因治疗
1、肠麻痹：针对麻痹性肠梗阻的致病原因进行相应治疗，如腹部手术后或腹膜炎等所致的肠麻痹给予胃肠减压后，可使病情大为好转。肾绞痛者给予解痉和肾囊周围封闭，可使肠麻痹减轻。卵巢囊肿蒂扭转等病因消除后，肠麻痹能自行痊愈等。应用各种副交感神经兴奋剂，如毒扁豆碱、新斯的明等，对预防和治疗麻痹性肠梗阻有一定疗效，交感神经抑制剂氯丙嗪等治疗也有效。腹胀明显，影响呼吸和循环功能，需行胃肠减压。脊髓麻醉或腰交感神经阻滞有暂时性作用，无持久的疗效。
2、肠梗阻：对于单纯性、不完全性肠梗阻，特别是广泛粘连者，一般选用非手术治疗；对于单纯性肠梗阻可观察24～48小时，对于绞窄性肠梗阻应尽早进行手术治疗，一般观察不宜超过4～6小时。基础疗法包括禁食及胃肠减压，纠正水、电解质紊乱及酸碱平衡失调，防治感染及毒血症。
3、腹膜炎：治疗原则上是积极消除引起腹膜炎的病因，并彻底清洗、吸尽腹腔内存在的脓液和渗出液，或促使渗出液尽快吸收、局限，或通过引流而消失。为了达到上述目的，要根据不同的病因、病变阶段、病人体质，采取不同的治疗措施。
二、药物治疗
1、导泻药：如乳果糖，使粪便不会发干而促进排便。
2、促动力药：常用的药物有莫沙必利和伊托必利，其作用机制是刺激肌肠间神经元，促进胃肠平滑肌蠕动，促进小肠和大肠的运转。
3、控制血压、降颅压药：如硝普钠、甘露醇。硝普钠可扩张血管、降低血压，甘露醇可降低出血后导致的颅内高压，可降低大脑再次出血的风险，促进恢复，从而有利于治疗脑出血后导致的急性便秘。
4、抗抑郁药：如文拉法辛，可改善患者的情绪，有利于治疗情绪因素引起的便秘。
三、手术治疗
肛裂切除术：可直接切除肛裂部位的皮肤，根治肛裂，从而消除因肛裂疼痛导致的便秘。