偏头痛原因主要是受遗传因素影响，大部分的偏头痛患者有家族史，患者的父母、子女以及兄弟姐妹发生偏头痛的风险是一般人群的5倍左右。还有内分泌与代谢因素的影响，女性偏头痛多见，多在青春期开始发病，常在月经期发作，妊娠期或绝经后发作减少或停止。某些食物可诱发偏头痛，如含酪胺的奶酪，含苯乙胺的巧克力，食品添加剂如谷氨酸钠等。情绪紧张、强光刺激也有可能诱发偏头痛。