肛窦炎是肛周感染性疾病的一种早期表现，是一种单纯性的感染性疾病。一般来说都是易过性的，不治疗就会好，但是有的病人出现慢性肛窦炎时，要用一些药物进行治疗，比如外用一些药膏、药霜和内服一些清热解毒、通便的药物。
如果肛窦炎没有治疗，贻误了治疗时间，会发展到肛周炎、肛周脓肿，甚至肛瘘层面上。一般而言，肛窦炎是一种易过性的疾病，当然也是种慢性的肛窦炎。肛窦炎最好的治疗方法是：
第一、用一些清热解毒、祛湿的中药内服或者中成药的内服；
第二、用一些痔疮膏、痔疮霜进行局部的治疗；
第三、用温水或者药物、中药汤剂进行肛门的局部的温浴来达到治疗的目的。