并发症与合并症的区别，在于前后两种疾病之间有无因果关系。有因果关系的就是并发症，无因果关系的就是合并症。
通俗来讲，并发症就是一种疾病在发展过程中，引起另一种疾病或症状的发生，比如急性心肌梗死引起室间隔穿孔、乳头肌断裂，那么室间隔穿孔和乳头肌断裂就是急性心肌梗死的并发症。再比如感冒引起肺炎，肺炎就是感冒的并发症。
而合并症就是在特殊的生理状况下，或者一种疾病在发展过程中，合并发生另外一种或几种疾病。后一种疾病不是特殊的生理状况或是一种疾病所引起的，也就是两种疾病之间没有因果关系，比如妊娠合并原发性高血压，高血压合并糖尿病，再比如糖尿病合并乙型肝炎等。