间充质软骨肉瘤目前认为的发病原因与基因突变有关，大多起源于骨组织，少数起源于软组织。受到辐射是该病的诱发因素之一，长期受到辐射的人容易导致细胞增生，产生肿瘤。
一、主要病因
人体受到一些物理、化学或生物因素的影响而产生基因突变，并在此基础上发展成间充质软骨肉瘤。基因突变主要表现形式为基因易位、基因融合等。
二、诱发因素
辐射引起的良性肿瘤的恶性转化是间充质软骨肉瘤的诱发因素。