生理脱毒阶段持续的时间与所吸食毒品种类、以及吸食毒品持续的时间和吸毒者本身的身体的基础状况，大部分患者在2周以内基本上可以消除。
当吸毒者在吸食毒品一段时间以后会产生依赖性，突然停止吸毒的时候身体会产生戒断过程，也叫做躯体阶段，是正常的生理反应。一般在停止吸毒几个小时到一天以内就会出现戒断反应，大概3-4天可以达到高峰，之后逐渐减轻，在2周内可以完全消除，这是基本的规律。但是持续的时间长短也有个体差异，有些个别患者会超过2周，大部分患者在2周以内基本上可以消除。但是戒断反应也十分痛苦，会出现各种症状，比如发冷、发热、剧烈的疼痛感，还有腹泻等等。
患者在经历了2周左右的生理脱毒阶段以后，仍然需要后面的心理疏导、社会帮助支持、改善与家人之间的关系等全方位的措施，帮助患者心理上的康复，防止复吸。