本病为自限性疾病，如果患儿血小板在30×10^9/L，出血不严重可不治疗，但应严密监测，如果血小板低于30×10^9/L，为防止颅内出血，在未得到实验室证实诊断之前即应开始治疗。现阶段，临床一线治疗的手段主要是糖皮质激素冲击治疗、静脉用丙种球蛋白治疗、血小板输注及新鲜血输注，重症患儿可使用换血疗法。
一、药物治疗
1、免疫球蛋白　：免疫球蛋白治疗NAITP的机制可能有三个方面，包括大量的免疫球蛋白输入，可以竞争巨噬细胞的Fc段受体，阻止Fc受体与PAIgG结合，封闭单核巨噬细胞的免疫功能，防止血小板的免疫损伤；非特异性免疫球蛋白可以干扰血小板与PAIgG的结合；免疫球蛋白可以提高抑制性T淋巴细胞的功能，抑制抗体的产生。免疫球蛋白与糖皮质激素有协同作用。大量的临床应用总结表明，静脉输注免疫球蛋白治疗NAITP效果肯定，尤其适用于妊娠期。据国外学者报道，孕妇每周1g/kg免疫球蛋白静脉输注可有效提高胎儿血小板计数，使胎儿、新生儿颅内出血发生率降低70%。
2、糖皮质激素：作用是使血小板较快恢复，降低血管通透性，减轻出血倾向。糖皮质激素冲击治疗较球蛋白冲击治疗的费用低廉，药物更为常见，过敏反应较少，而且无传播血源性疾病的可能，因此临床常选用糖皮质激素冲击治疗。以往研究指出，泼尼松是临床治疗同族免疫性血小板减少性紫癜的最好药物，但是实际用药治疗过程中，长期疗效并不是十分理想，同时长期持续治疗后，还会增加患儿不良反应的发生率、继发感染率。
3、止血药物的应用：由于血小板异常所致出血可用酚磺乙胺(止血敏)，弥散性血管内凝血高凝期用肝素，消耗期可同时补充凝血因子和加用肝素，纤溶亢进期可在肝素基础上加用抗纤溶制剂如氨基己酸、氨甲苯酸(对羧基苄胺)。
二、手术治疗
此病一般无需手术治疗。
三、其他治疗
1、输血小板：血小板<10×10^9/L或出血危及生命的患者，可考虑输血小板。
2、输新鲜血：输入血小板同型的血，所输血小板虽可被患儿血内抗体所破坏，但实际上可消耗抗体，有利于病情恢复，特别是当发生严重出血时，可作为急救措施。