因为IgA肾病的临床表现形式比较多，以肾病综合征为表现者，而且在病理上发现有小的新月体形成，肾功能正常，没有明显的肾小管萎缩和间质纤维化等，可以采用短期的免疫抑制剂治疗，包括糖皮质激素及联合环磷酰胺等，个别情况下可以使用钙调磷酸酶抑制剂，其目的是改善预后，防止肾功能的进行性减退。
在采用免疫抑制剂治疗的同时，一定要注意其明显的毒副作用，做好定期复查，同时对IgA肾病的治疗仍然推荐使用ACEI、ARB类药来控制蛋白尿和高血压等。