蛋白尿的治疗方法要根据尿蛋白的多少和肾脏病理改变决定，如果是单纯性蛋白尿，不伴有明显的低蛋白血症，可以考虑使用ACEI和ARB药，降低肾小球的压力来达到减少尿蛋白的目的；对于明显蛋白尿伴有低蛋白血症，即肾病综合征的患者，可以根据病理类型进行治疗，可以使用激素或者免疫抑制剂治疗。
其他原因导致蛋白尿，如高血压以及系统性红斑狼疮、狼疮性肾炎、过敏性紫癜性肾炎以及糖尿病肾病等等，需要进行原发病的治疗，如抗过敏、控制高血压、控制血糖、降尿酸及免疫抑制治疗，在治疗过程中，要动态观察尿蛋白的变化以及定量的改变。