新生儿寒冷损伤综合征的临床症状包括三大主征，即低体温、皮肤硬肿和多器官功能损害，可并发休克、心功能低下、心肌损害、弥散性血管内凝血、肺出血、急性肾功能衰竭、酸碱或电解质失衡、内分泌调节等多系统功能损害。
1、低体温：全身或肢端凉，体温常在35℃以下(80.7%)，严重者可在30℃以下(13.3%)。低体温患儿中以早产儿和低出生体重儿居多。
2、硬肿：包括皮脂硬化和水肿两种病变，以硬化为主者多为出生一周后或感染、病情危重者；以水肿为主者多为生后1~2日或早产儿。硬肿为对称性，累及的多发部位顺序依次为下肢(92.9%)、臀(90%)、面颊(67.1%)、上肢(47.1%)、背、腹、胸部等，严重者可出现体温降低、心率及呼吸减慢、运动减少。
3、多器官功能损害：本病早期常有拒乳、不哭等反应低下的表现，随着体温降低，硬肿出现或加重，可伴有循环障碍如休克、心功能低下、心肌损害、弥散性血管内凝血、肺出血、急性肾功能衰竭、酸碱或电解质失衡、内分泌调节等多系统功能损害表现。