黄斑囊样水肿发病的原因有很多，多是由于视网膜疾病导致，临床上常见的有视网膜的静脉栓塞，糖尿病视网膜病变，视网膜血管炎，白塞氏病，高度近视，脉络膜肿瘤，黄斑前膜等刺激导致黄斑囊样水肿。另外在内眼手术时，例如人工晶体植入手术或者是视网膜脱离复位手术，由于光线灼伤或者是手术扰动玻璃体以及手术操作过程中前列腺素破坏血-视网膜循环屏障而导致黄斑囊样水肿的发生。