锁骨上淋巴结肿大的原因有病原体感染、肿瘤因素、风湿免疫性疾病等，具体如下：
1、病原体感染：如细菌、病毒等病原体感染，常见的疾病有急慢性淋巴结炎、淋巴结核，面部、扁桃体、头部等局部组织的细菌感染，及传染性单核细胞增多症、HIV病毒感染、梅毒、钩端螺旋体病等；
2、肿瘤因素：包括原发性肿瘤和继发性肿瘤，都可以引起锁骨上淋巴结的肿大，其中原发性肿瘤包括霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、淋巴细胞性白血病等，继发性肿瘤较多，包括鼻咽癌、甲状腺癌、口腔癌、乳腺癌、肺癌、食管癌、胃癌、肝癌、大肠癌、宫颈癌、卵巢癌等恶性肿瘤的淋巴结转移；
3、风湿免疫性疾病：主要有类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等。