清开灵颗粒和连花清瘟胶囊的区别主要在于药物组成成分、药物功效、药物适应证三方面，在使用前应注意仔细阅读说明书，或者遵医嘱使用。

1、药物组成成分：清开灵颗粒由胆酸、珍珠母、猪去氧胆酸、栀子、水牛角、板蓝根、黄芩苷、金银花组成。连花清瘟胶囊由连翘、金银花、炙麻黄、炒苦杏仁、石膏、板蓝根、绵马贯众、鱼腥草、广藿香、大黄、红景天、薄荷脑、甘草组成；

2、药物功效：清开灵颗粒主要具有清除体内热毒邪气，镇定、安神的功效。连花清瘟胶囊具有清除瘟热毒邪，宣发肺内热邪的功效；

3、药物适应证：清开灵颗粒主要适用于外感风热邪气引发的发热、烦躁不安、咽喉肿痛，以及现代医学中的上呼吸道感染等疾病出现上述证候者。连花清瘟胶囊主要适用于热毒袭肺部引发的发热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽、头痛、咽干、咽痛等不适症状治疗，以及现代医学中流行性感冒出现上述证候者。

以上两种药物都能够缓解新型冠状病毒感染导致的不适症状，建议根据自己的症状选择其中一种药物使用。