阿法骨化醇软胶囊能促进肠道对钙、磷的吸收，升高血清钙的水平，促进骨骼钙化。另外，可以通过降低血浆中甲状旁腺激素水平，防止骨钙丢失，临床主要用于改善慢性心功能不全、甲状旁腺功能低下，以及抗维生素D的佝偻病、骨软化症患者。治疗因维生素D代谢异常引起的症状，如低钙血症、抽搐、骨痛及骨损害，也可以用于骨质疏松的治疗，在服用该药同时可酌情补充钙剂。
阿法骨化醇软胶囊的常见不良反应是偶见胃肠道的反应，会引起食欲不振、恶心、呕吐、腹泻、便秘等，还会引起转氨酶的升高。中枢神经系统可引起头痛、失眠、急躁、疲倦等，服药期间要密切监测血钙和尿钙的水平，避免发生高钙血症。