抗痤疮丙酸杆菌，临床药物众多。首先是外用药物方面，可以选择抗生素类药物，常见的比如夫西地酸乳膏、红霉素软膏、克林霉素磷酸酯凝胶等，还可以选择维甲酸类的药物，常见的比如阿达帕林凝胶、他扎罗汀凝胶、维A酸乳膏等，也可以选择中药类，常见的有姜黄消痤搽剂、七味姜黄搽剂等，其他的还包括5%-10%水杨酸软膏、过氧苯甲酰凝胶、硫磺乳膏、二硫化硒洗剂、克痤隐酮凝胶等。
其次，系统用药方面，可以选择抗生素类，常见的比如盐酸多西环素片、盐酸米诺环素胶囊等，还可以选择中成药类，常见的比如金花消痤丸、丹参酮胶囊、复方珍珠暗疮胶囊等。