深呼吸会咳嗽，一般说明肺里面可能有异常的东西，有可能是污染以后沉积的杂质，也可能是肺里面生痰引起。痰有可能是以前出现炎症留下的，也可能是现有的，机体内有慢性炎症也可以引发深呼吸后咳嗽。越是做更深的呼吸引发的咳嗽，则说明痰的位置是比较深的。
如果有气道的炎症，不做深呼吸，有时大声说句话痰可能就上来了，但如果需要做比较深的呼吸，才能引发咳嗽的痰，说明位置比较深，比如间质性肺病。在以前认为它根本是没有痰的，但现在发现其实是可以排痰的，只不过需要做更大的努力。间质性肺病在康复时，经常要求患者尽可能做深呼吸帮助肺内的痰排出。