阴道纵隔的患者多数没有症状，少部分患者有性交发生困难或者是性交时疼痛；也有部分患者合并双子宫，双宫颈以及肾脏发育不良，会出现不孕。纵隔偏向一侧，也可能引起经血潴留、分泌物异常等。
一、典型症状
1、性交困难：不完全性阴道纵隔可能阻碍阴茎的进入，不能完成正常性生活。
2、疼痛：在进行性生活时受阻而引起疼痛。
二、其他症状
阴道纵隔者如合并子宫畸形，可能还会伴有不孕。纵隔偏向一侧，也可能引起经血潴留、分泌物异常等。部分患者在分娩时受阻才发现和确诊。