米诺环素仅对部分支原体、衣原体引起的非淋性尿道炎有效。非淋菌性尿道炎是指淋病双球菌以外其他致病微生物感染引起的尿道炎症性病变总称，属于性病。引起非淋菌性尿道炎的病原微生物有多种，常见的有衣原体、支原体、霉菌、滴虫等。米诺环素属于四环素族类抗生素，对于衣原体、支原体治疗有效，而对霉菌和滴虫无效。即使在支原体感染引起的非淋性尿道炎中，有一部分支原体会对米诺环素耐药，因此需要行尿道分泌物的支原体培养加药物敏感试验，以确定支原体是否对米诺环素敏感，指导用药。