1、血常规、血红细胞沉降率：小儿骨与关节结核患者血常规显示轻度贫血，白细胞计数一般正常，混合感染时白细胞及中性粒细胞计数增多；血红细胞沉降率在结核活动期明显增快，可用于判断病变的活动度和对疗效的评价。
2、细菌学检查：
（1）涂片染色镜检：操作简便，但不敏感，含菌量在5000～10000个/毫升才可检出阳性。骨关节结核标本染色镜检阳性率远低于肺结核，但其结果只能说明有抗酸杆菌，不能区分是结核分枝杆菌还是非结核分枝杆菌，由于非结核分枝杆菌致病的机会较少。
（2）培养法：是结核病诊断的“金标准”，同时也为药物敏感性测定和菌种鉴定提供菌株。取骨或关节穿刺液采用“改良罗氏法”于实验室中培养2~8周，观察培养皿中是否出现结核杆菌。
（3）其他检测技术：如PCR(金标准，确定分枝杆菌的菌群，但容易发生交叉污染，假阳性率较高)、核酸探针检测特异性DNA片段、色谱技术检测结核硬脂酸和分枝杆菌等菌体特异成分以及免疫学方法检测特异性抗原和抗体、基因芯片技术(对结核病及耐多药结核病具有较高的诊断价值)等检测出结核分枝杆菌。但这些方法仍在研究阶段，尚需改进和完善。
3、结核菌素试验：结核菌素试验广泛应用于检出结核分枝杆菌，而非检出结核病。结核菌素试验对儿童结核病诊断有参考意义。由于目前很多国家推行卡介苗接种，结核菌素试验阳性不能区分是结核分枝杆菌的自然感染感染还是卡介苗接种的免疫反应。结核分枝关节感染后4~8周后才可出现阳性反应；营养不良、HIV感染、麻疹、水痘、癌症、严重的细菌感染包括重症结核病如粟粒性肺结核和结核性脑膜炎等，结核杆菌试验结果多为阴性或弱阳性。
4、MRI检查：小儿骨与关节结核典型MRI表现为骨质破坏在T1W1呈混杂低信号或均匀信号，在T2W1上表现呈混杂高信号，部分呈均匀高信号，病灶内死骨可使T1W1、T2W1信号明显不均匀，T2抑脂序列对病变显示更佳。
5、病理学检查：通过对病变部位进行穿刺活检、手术等方法取得标本，并在病理科进行病理检查，在镜下可发现结核分枝杆菌。取材部位、标本量的多少和切片的制作工艺等均可影响病理学检查的准确性。结核病发生在不同部位、不同阶段，甚至不同患者时其病理表现各不一样。
6、X线检查：对诊断小儿骨与关节结核有重要意义。松质骨中心型结核初期可见局部骨小梁模糊，呈现磨砂玻璃样改变。继之可见游离死骨，其形状呈椭圆形，密度比周围松质高，死骨吸收后可见骨空洞。边缘型松质骨结核显示局限性溶骨性破坏，边缘稍致密。密质骨结核主要是髓腔内溶骨性破坏，骨膜有新骨形成。单纯性滑膜结核仅表现骨质疏松和局部软组织肿胀。而早期全关节结核除以上表现外，还可见关节面模糊和不规则破坏，晚期全关节结核的关节边缘大部分模糊和破坏，关节间隙狭窄或消失，常合并关节脱位和畸形。椎体结核可见脊柱生理曲线改变，椎体破坏，椎间隙变窄或消失。因脓液向两侧扩散，故椎旁两侧软组织阴影增宽或有钙化。