空蝶鞍综合征的病因和发病机制较为复杂，至今未完全阐明。可能是先天性鞍隔发育缺陷、肿大的垂体缩小后发生空蝶鞍引起的，好发于40岁作右的女性、经产妇者、有家族史者，鞍内手术史、肥胖等因素容易诱发。
一、主要病因
1、原发性空蝶鞍综合征：
（1）病因至今尚未完全阐明，主要与下列因素有关。
（2）鞍膈的先天性解剖变异：鞍膈不完整或缺如时，在搏动性脑脊液压力持续作用下使蛛网膜下隙疝人鞍内。
（3）脑脊液压力：尤其是慢性颅内压增高可造成空蝶鞍。
（4）鞍区蛛网膜粘连：是本病发生的重要因素之一。
（5）内分泌因素：在妊娠期垂体呈生理性肥大，可增大2~3倍，多胎妊娠时尤为明显，妊娠中垂体变化有可能把鞍膈孔及垂体窝撑大，而分娩后垂体逐渐回缩，使鞍膈孔及垂体窝留下较大的空间，有利于蛛网膜下隙疝人鞍内。原发性空蝶鞍多见于多胎妊娠的中年妇女可能与此有关。有内分泌靶腺(性腺、甲状腺、肾上腺)功能减退或衰竭者垂体可增生肥大，用相应靶腺激素替代治疗后，可使增生的垂体回缩，从而产生空蝶鞍。
（6）年龄因素：40岁以后随年龄的增加空蝶鞍的发生率明显增高。
2、继发性空蝶鞍综合征 ：
（1）垂体瘤手术或放射治疗后引起局部粘连或肿瘤坏死，可牵引蛛网膜下隙疝入垂体窝内。
（2）垂体肿瘤梗死、卒中或退变，临床可见鞍内疝与垂体肿瘤共存。
（3）继发于Sheehan综合征，常同时伴有甲状腺功能减退和慢性肾上腺皮质功能减退表现。
（4）继发于淋巴细胞性垂体炎，使垂体萎缩而形成空蝶鞍综合征。
（5）特发性颅内高压常导致失明，有时并发ESS。
（6）偶尔在用GnRH给垂体瘤病人做垂体储备功能试验时或在治疗中可诱发部分性ESS。
二、诱发因素
1、鞍内手术史的患者：手术过程容易损伤鞍膈孔和垂体窝。
2、肥胖：肥胖的人群容易引起颅内压升高，进而导致蛛网膜下腔疝入垂体窝。