所谓的多基因遗传病，遗传基础是由多个致病基因或易感基因与环境因素协同调控，发病机制比较复杂，而且人种之间也存在较大的差异。若干对基因作用积累后，形成了明显的表型效应，则称之为累加效应。在微笑基因中可能也会存在起到主要作用的基因，称为主基因。主基因对于了解多基因疾病的发生、诊断、治疗以及预防都会有着十分重要的意义。
多基因疾病都有一定的家族史，但是不会像单基因遗传中能够看到非常明显的系谱特征。人类常见的疾病，比如高血压、动脉粥样硬化、糖尿病、精神分裂症等，均属于多基因的遗传病。如果曾经生育过多基因相关出生缺陷患儿的夫妇，发生再次风险则为3%-5%左右。