手掌深部间隙感染是一个急症疾病，需要尽早处理，不能拖延，早期治疗可以有效控制炎症加重，缩短治疗周期，一般7~14天就可以治愈，患者可以口服青霉素、甲硝唑、左氧氟沙星等药物，但部分患者病情拖延或者严重时，需要手术治疗，手术治疗周期延长。
一、药物治疗
手掌深部间隙感染是由于细菌感染而导致的继发性感染，一般以消炎杀菌药物为主。
1、青霉素：青霉素分子中含有青霉烷，能破坏细菌的细胞壁，并在细菌细胞的繁殖期起杀菌作用，每次使用前必须做皮试，以防过敏。青霉素对革兰氏阳性菌有效，可采用口服或者注射给药。
2、甲硝唑：用于治疗或预防厌氧菌引起的系统或局部感染，如腹腔、下呼吸道、皮肤及软组织、骨和关节等部位的厌氧菌感染，对败血症、心内膜炎、脑膜感染以及使用抗生素引起的结肠炎也有效，一般手掌间隙感染为口服以及注射给药。
3、左氧氟沙星：喹诺酮类药物中的一种，具有广谱抗菌作用，抗菌作用强，对多数肠杆菌科细菌以及金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、化脓性链球菌等革兰阳性菌有效，主要为口服给药。
二、手术治疗
1、掌中间隙感染：治疗可用大剂量抗生素，局部早期处理同脓性指头炎，如短期内无好转，应及早切开引流，纵行切开中指与无名指间的指蹼，切口不应超过手掌远侧横纹，以免损伤动脉的掌浅弓，用止血钳撑开皮下组织，即可达掌中间隙。亦可在无名指相对位置的常远侧横纹处作一小横切口，进入掌中间隙。
2、鱼际间隙感染：一般的治疗与掌中间隙感染相同，引流的切口可直接作在大鱼际最肿胀和波动最明显处。亦可在拇指、示指间指蹼处作切口，或在手背第二掌骨桡侧作纵切口。