诊断明确的较小的肝脏局灶性结节性增生可暂不手术，密切观察。对症状明显、肿块迅速生长或由于病变区域较大，引起门静脉高压等并发症的患者，宜通过外科手术治疗。
一、药物治疗
肝脏局灶性结节性增生是一种良性肿瘤病变，一般可以观察，不需要口服药物。但如果肿块比较大，局灶性结节性增生引起肝功能不全甚至衰竭，可以考虑保肝药物治疗。
二、手术治疗
1、开腹局部肝切除术：手术适应症为病变压迫周围器官或组织、小的腹部损伤引起的大出血、病变较大，引起腹胀、有症状或不能除外恶性倾向者、病变继续增大可能引起破裂出血者、有蒂病变可能出现扭转或梗塞者，患者术后预后较好。
2、腹腔镜下局部肝切除术：目前腹腔镜下肝切除技术已逐渐成熟，更有利于患者快速恢复，出血量更少，肠道排气和住院时间更少，术后患者健康状况良好，预后较为满意。
3、肝移植：极少数肝脏局灶性结节性增生患者病灶较大、症状明显、病情较重导致肝衰竭，需进行肝移植治疗。
三、其他治疗
1、肝动脉化疗栓塞：肝动脉化疗栓塞治疗指征为病灶有增长趋势、压迫等相关症状，不宜进行外科切除，或者有外科治疗适应症但患者拒绝接受外科治疗者。该方法是治疗肝脏局灶性积结节性增生的安全、有效的方法，可获得控制病灶增长，甚至根治效果。
2、射频消融：射频消融治疗肝脏局灶性结节性增生是一种安全高效的微创治疗方法，治疗后患者可有轻度局部疼痛，在2~6天内逐渐消失，一般无并发症出现。治疗后复查结节体积可缩小或消失，结节内血管可完全被破坏。