胃镜检查结合组织病理学检查技术是诊断贲门癌的主要方法和手段。在进行胃镜检查的时候，贲门癌的局部表现多种多样，包括贲门局部出现区域狭窄，胃镜通过困难。或者出现贲门区域的局部粘膜损伤，包括粘膜完整性中断，或者部分粘膜出现黏膜损伤，出现类似火山口样的改变，肿块区域容易出现触碰性出血，黏膜底部伴有污秽样的分泌物。这些表现都可能是贲门癌的胃镜下表现，但是临床确诊，主要还是依据镜下组织活检并且病理学确诊。