为了去除颅底脊索瘤，最好的办法还是以手术切除为主。手术之后联合术后放疗通常被认为是最佳的治疗方案，脊索瘤的特点是容易复发，而且到目前为止对于脊索瘤的治疗还不能让人满意，因为不管是采用哪种治疗方法，脊索瘤的局部复发率仍然特别高，而且脊索瘤复发后容易引起患者术后病情加重，导致患者死亡。目前手术联合、术后放疗是最佳的治疗方案，但是五年后患者的复发率仍然可以高达60%-70%，为了提高颅底脊索瘤的生存率，目前对于该疾病的治疗仍在积极的探索。