抗真菌药物治疗。一、局部使用抗真菌药物治疗，包括多烯类，如0.25%两性霉素B滴眼液、5%那他霉素滴眼液。咪唑类如0.5%咪康唑滴眼液。嘧啶类如1%氟胞嘧啶滴眼液，0.15%两性霉素B和5%那他霉素滴眼液是抗真菌药物的一线药物。如果实验室检查证实病原菌是丝状菌属，则首选5%的那他霉素，如果病原菌是酵母菌属，则可选用0.15%两性霉素B、2%氟康唑，5%那他霉素或1%氟胞嘧啶。联合用药方案有氟胞嘧啶加两性霉素B或氟康唑、利福平加两性霉素B等，也可结膜下注射抗真菌药物，如咪康唑5-10毫克或两性霉素B 0.1毫克。也可以全身使用抗真菌药物，如静脉注射咪康唑10-30毫克每千克体重，每天分三次给药，每次用药量一般不超过600毫克。起效后，药物治疗至少需要维持六周。二、并发虹膜睫状体炎者，应该使用1%阿托品滴眼剂或眼膏来散瞳，不宜使用糖皮质激素。三、手术治疗包括清疮术、结膜瓣遮盖术和角膜移植术。早期施行病灶清除术，可以使药物进入角膜基质，提高病灶中的药物浓度和清除病原菌。结膜瓣遮盖术，可以清除角膜真菌同时又可以利用结膜瓣供血充分的特点来提高药物的渗透性，使角膜局部的药物浓度增高，而达到杀灭真菌的目的，但是为病理性的愈合会遗留明显的角膜瘢痕。角膜溃疡接近或已经导致穿孔，可考虑行治疗性角膜移植，以传统性角膜移植。