急性化脓性甲状腺炎的发病机制尚不清楚，主要病原菌多为葡萄球菌、链球菌或肺炎球菌等，多为临近组织扩散感染，少数继发于败血症或开放性外伤累及甲状腺部位。
一、主要病因
1、急性化脓性甲状腺炎是由化脓性细菌血行播散，或邻近组织感染扩散直接蔓延到甲状腺所致，常见的致病菌为金黄色葡萄球菌、革兰阴性菌、溶血性链球菌、肺炎链球菌等。
2、部分可见于淋巴管途径、直接创伤以及通过残留的甲状腺舌管的炎症发生，这是由于梨状隐窝瘘管易发生感染，继而扩散至甲状腺。
二、诱发因素
存在甲状腺疾病或甲状腺结构异常，包括梨状窦瘘、甲状腺肿、甲状腺舌管囊肿和甲状腺癌的存在，容易诱发感染，引起该病。