产后甲状腺功能减退，首先考虑的是产后甲状腺炎，产后甲状腺炎可以引起甲减，但是绝大部分情况都能自愈。产后甲状腺炎是自身免疫性甲状腺炎里面的一种，是由于免疫系统出了错误，把甲状腺某些自身成分认为是敌人产生了防御反应，这种自身免疫的防御反应，可以造成甲状腺组织一过性的破坏，短时间可以出现甲状腺激素水平过高。但是可以进一步发展为甲状腺功能一过性的降低，随着疾病的好转痊愈，一过性的产后甲状腺功能减退能完全恢复，很少会遗留终身性的甲减。
但是也有些产后甲减是由于真正的自身免疫性桥本甲状腺炎引起，那么桥本甲状腺炎引起甲状腺组织破坏往往是长期的不可逆，就需要进行相应的长期治疗。但是产后甲状腺功能减退最常见的原因是考虑产后甲状腺炎，产后甲状腺炎引起的甲减通常能够自愈。