亚急性心内膜炎最常见的病原体是草绿色链球菌。这种细菌的感染能诱发一些急性炎症表现，比如急性咽炎，急性扁桃体炎，急性牙龈炎。因为一些有创操作或免疫力低下，导致草绿色链球菌进入血液，随血液运送到心内膜处，细菌繁殖并产生免疫反应，引起亚急性细菌性心内膜炎。一方面可能有较严重的全身感染性表现，比如血小板降低，反复高热。另一方面也可能损害心脏的瓣膜，形成瓣膜的损害。