女性臀部两侧肌肉酸痛可能存在以下几种原因：1、臀部臀大肌、臀中肌外伤或者劳损，局部肌肉拉伤酸痛不适。这种酸痛一般都有拉伤或者劳损病史，经过休息明显减轻。2、腰椎间盘突出症，腰椎间盘突出症初期阶段，间盘突出还没有很大，刺激神经根较轻，仅仅导致臀部放射痛。这种疼痛多伴有腰痛症状。3、女性臀部疼痛还可以考虑是骶髂关节问题，比如骶髂关节炎、致密性骨炎等疾病，多因劳累，着凉等原因发病。