预防乙脑和流脑的疫苗不能一起打，流行性乙型脑炎和流行性脑脊髓膜炎流行发病有严格的季节性，预防接种时间也有所不同。乙脑多于7-9月份发病，人是终末宿主，感染后病毒血症短暂、病毒载量低，传播病毒的作用不大，蚊虫是乙脑病毒主要传播媒介，在乙脑流行中起到重要作用。通常在流行季节前一个月，也就是每年4-5月份接种乙脑疫苗，在乙脑流行季节前1-2个月开展灭蚊活动，户外活动注意防蚊虫叮咬。
流行性脑脊髓膜炎也有明显季节性，多在冬春季节发病，多呈散发性流行，流行与室内活动多、空气不流通、阳光缺少、居住拥挤、患上呼吸道病毒感染等因素有关。