虹膜缺损根据病因和部位不同将其分为以下两大类：
1、先天性虹膜缺损：在胚裂区从脉络膜到虹膜缺损，系先天胚裂闭锁不全所致。常伴有睫状体、脉络膜、晶状体缺损，有时合并先天性小角膜及部分视神经缺损。典型表现为虹膜下方缺损，呈现尖头向下的倒梨形。小的虹膜缺损不影响视力，因为常伴有脉络膜缺损等，有的影响视力。
2、后天性虹膜缺损：多继发于眼部手术、虹膜变性、炎症、角膜虹膜内皮综合征等。