黄连素不能用来治疗胃炎。胃炎是由多种原因引起的胃黏膜炎症，是胃最常见的消化系统疾病之一，根据临床发病的缓急，可以分为急性胃炎和慢性胃炎两大类型，根据病因不同，可分为幽门螺杆菌相关性胃炎、应激性胃炎、自身免疫性胃炎等。黄连素在临床上主要用来治疗因细菌感染引起的腹泻，对于胃炎并没有明确的治疗作用，而且黄连素对胃肠道有一定的刺激性，容易引起恶心、呕吐等症状。
当患有胃炎时可，以选择H2受体拮抗剂，如盐酸雷尼替丁片、西咪替丁，还有质子泵抑制剂，如奥美拉唑肠溶胶囊、兰索拉唑，此外，还有胃黏膜保护剂，如胶体果胶铋、硫糖铝，或者采用中医中药辨证进行治疗。因幽门螺杆菌感染引起的胃炎，要采用两种抗生素加一种质子泵抑制剂，再加一种胃黏膜保护剂来治疗。另外，要戒烟、忌酒，避免使用损害胃黏膜的药物，比如阿司匹林、消炎痛、红霉素肠溶片等。此外，还要饮食规律，要清淡饮食，避免过热、过咸、过于辛辣的食物。