乌梅丸具有暖肝调中、清上温下的功效，主要用于治疗蛔厥、久痢、厥阴头痛等，此时患者身体可能会出现腹痛下痢、巅顶头痛、烦躁、呕吐、手足厥冷等症状。乌梅丸具有治疗慢性肠炎、蛔虫等疾病的作用，该药是由多种中草药组成，属于寒热混杂的药物，热性药包括干姜、细辛，寒性药包括黄连、黄芩等。
在《伤寒杂病论》的记载中，乌梅丸可以杀死体内的蛔虫，可当做驱虫药使用。此外，乌梅丸还可以治疗慢性腹泻。目前临床上主要用乌梅丸治疗体质情况较复杂的患者，比如经常嗓子发炎、咽喉肿痛，同时伴有腹泻、手脚冰凉者。对于寒热混杂的体质，乌梅丸具有良好的治疗效果，但孕妇不能使用。