关于儿童恐惧症的病因并没有一个系统性的研究，大多认为儿童恐惧症的来源较多，包括家庭教育、特殊经历和遗传因素等，都对发病有一定的影响。
1、家庭教育：父母对孩子溺爱，过度限制儿童的行动；用吓唬、威胁的方法对待孩子的不听话、不顺从；有的父母当着孩子的面绘声绘色地讲述自己经历过的一些可怕的事情；有的父母对某一事物或现象存在恐惧，在孩子面前毫不掩饰地表现出来，使孩子也深受其害。
2、特殊经历：突发或意外事件的惊吓，如自然灾害或发生重大生活事件，可造成儿童心理应激，引起过度而持久的恐惧反应。
3、遗传因素：父母患有余光恐惧症，会对子女产生影响。家系研究也发现，在恐惧症儿童的一级亲属中，社交恐怖和儿童焦虑障碍的发生率高。