临床认为眼角膜薄的患者不适合做全飞秒激光近视手术。全飞秒激光近视手术是全程使用飞秒激光制作微透镜状的眼角膜薄片，从而改变眼角膜的屈光力，达到矫正近视的目的。该手术需要切割眼角膜来矫正视力，所以不适用于眼角膜薄的近视患者。
若眼角膜薄的患者强行进行全飞秒激光近视手术，由于其手术设计本身需要切削的眼角膜较多，剩余的眼角膜太薄，无法抵抗眼内的压力，可能会导致视力下降甚至失明。
眼角膜薄的患者若想通过手术的方式矫正视力，可在医生指导下进行半飞秒激光手术中的准分子激光上皮瓣下角膜磨镶术，该手术切削眼角膜较少，对眼角膜厚度要求较低。也可以进行晶体眼人工晶体植入术，该手术无需对眼角膜进行切削，对眼角膜厚度无要求。