卵巢囊肿的手术分为卵巢囊肿剥除术和卵巢切除手术。做了卵巢囊肿剥除术的术后有复发的可能性，卵巢的上皮细胞增生分化能力较强，仍然有可能长这种，或者其他种类的肿瘤。做了卵巢切除手术的，术后不会再长囊肿了，但是卵巢是女性的重要的内分泌器官，分泌雌孕激素，切除卵巢会导致更年期提前，容易衰老，所以年轻患者不建议切除卵巢。