IgA肾病二期一般不算太严重，这时主要是根据病理表现，结合临床表现来给病人相应的治疗。首先对于IgA肾病的病人来说，通常沿用李式分级法，李氏分级法一般分为五级。第二期时肾小球会出现弥漫的系膜增殖和系膜基质增多，但是还不是太严重，因为肾小管一般没有受到明显损伤，所以这时的临床表现也不太严重，大多数病人往往表现为血尿，或者是少到中等量的蛋白尿，一般很少会表现为大量蛋白尿。
这个时候的治疗主要也是根据临床表现来进行，如果病人尿蛋白量偏多，可以给病人应用激素来进行治疗，如果激素效果不好，还可以用激素加上细胞毒类药物，或者激素加上免疫抑制剂进行治疗，但是总体来说IgA肾病二期一般不严重。