小儿病毒相关吞噬血细胞综合征的预防主要在于减少病毒感染的风险，同时增强免疫力，保持环境卫生整洁，降低病毒感染的几率。
（1）保持生活环境的卫生和个人卫生，如定期对居住环境消毒，减少病毒滋生以及患儿衣物、碗筷等定期消毒。
（2）不给孩子乱服用药物。
（3）成人与儿童接触时要注意接触位置的干净，避免引起交叉感染。