乳腺囊肿在多数情况下不需要做特殊治疗，尤其是药物治疗，对乳腺囊肿没有明确疗效。乳腺囊肿的形成和雌激素的分泌增加，退化时腺体出现差错，或者腺体里液体的潴留有关，常常是乳腺增生中的一种。
乳腺囊肿呈多发性，在乳腺囊肿是囊实性或内部雌性部分可能是恶性病变的时候，需要做穿刺或者手术切除病理，在这种情况下，怀疑有不好的变化时才需要治疗，只有外科手术或者穿刺来确诊，用药没有明显效果，所以，单纯的乳腺囊肿不需要特殊治疗，因为口服药物没有明显疗效，在必须的时候可以行手术切除，但是乳腺囊肿即使手术切除后，再发的可能性也有，而且比较大，切除更多是根断的目的，对于单纯囊肿的治疗，手术效果也非常不好。