小儿毛细支气管炎的病因为病毒感染导致下呼吸道，即细支气管梗阻所致，最常见的病原体为呼吸道合胞病毒。本病主要好发于2~6个月小婴儿、早产儿及低体重出生儿。
一、主要病因
1、小儿毛细支气管炎直接病因为病原体感染，包括病毒、细菌及支原体混合感染。常见病原体为呼吸道合胞病毒，容易引起重症及暴发流行，其他病原体可包括副流感病毒、腺病毒、人偏肺病毒等。此外，肺炎支原体、衣原体感染也可引起小儿毛细支气管炎。
2、病原体引发的病变主要累及内径在2mm以内细支气管微小管腔，局部管腔水肿、黏液分泌亢进、平滑肌收缩及气道细胞坏死脱落更易造成阻塞现象，引起肺不张或肺气肿，严重影响肺部通换气功能。
二、诱发因素
1、婴幼儿免疫能力较差，着凉、腹泻、营养不良、贫血等因素可加重其免疫功能低下症状，进而容易感染病毒，诱发小儿毛细支气管炎。
2、在小儿毛细支气管炎流行季节，儿童可通过共同生活的伙伴咳嗽、打喷嚏、接触物品、衣物等途径造成传播，进而导致小儿毛细支气管炎的发生。