腘窝囊肿手术时，采取俯卧位，硬膜外麻醉，麻醉成功之后，手术区消毒、铺手术巾。逐层切开皮肤、皮下组织，剥离肌肉层，到达腘窝囊肿病灶位置。完整切除腘窝囊肿的囊壁以及里面的胶冻样物质，避免破裂，避免伤及腘窝的动静脉以及神经组织，然后清点纱布、器械无误，创口内止血，放置引流条，缝合皮下组织，缝合皮肤，用无菌敷料包扎。