百草枯中毒的临床表现与百草枯吸收途径和吸收量有关，潜伏期时间也有不同。口服大量百草枯数分钟后即可发生恶心、呕吐症状，量小者数小时至数十小时才发病。皮肤吸收者数天后可发病，可出现多系统损害。
1、呼吸循环系统：主要有胸闷、气短，进行性呼吸困难。严重者1~3天内可迅速发生肺水肿及肺炎表现，可因急性呼吸窘迫综合征致死。
2、消化系统：主要表现为口腔及食管损伤，恶心、呕吐、腹痛，甚至出现呕血、便血，个别患者可出现食管黏膜表层剥脱症，可有胆汁淤积性黄疸。
3、泌尿系统：中毒数小时后即可出现蛋白尿、血肌酐和尿素氮升高，严重者出现急性肾衰竭，无尿者提示病情较重，肾功损害往往早于肺损害。
4、神经系统：多见于严重中毒患者，可出现头痛、头晕、意识障碍及精神症状等。
5、内分泌系统：部分患者可出现甲状腺功能减退。
6、其他局部表现：皮肤污染可引起接触性皮炎及药疹样皮炎，表现为皮肤红斑、大疱，局部溃烂。眼污染百草枯后可出现刺激症状，表现为流泪、畏光、结膜充血、视物模糊等，一般不引起永久性视神经损害。