甲状腺功能减退，最常见的病因，就是自身免疫损伤，造成的甲状腺细胞损伤，从而导致甲状腺功能减退。常见桥本氏甲状腺炎，血液中的抗甲状腺球蛋白抗体，及抗甲状腺功能抗体，是明显升高的，由于这两个抗体的存在，所以会导致甲状腺细胞损伤。另外还有研究发现的，大量碘的摄入，也会诱发自身的免疫反应，或者是加重甲状腺细胞损伤。因为海带，包括紫菜，是含碘量比较高的食物，所以对存在甲状腺功能减退的病人，特别是伴有两个抗体水平明显升高的，不建议吃含碘量比较高的食物。同时，有一些含碘量比较高的药物，比如胺碘酮，对于甲减病人也是禁忌的。