婴儿抽脑脊液没有后遗症，医务人员一般是通过腰椎穿刺来抽取脑脊液。规范的腰椎穿刺很少有并发症，也没有什么后遗症。通过对脑脊液的化验检查，对中枢神经系统疾病，如脑炎的诊断有很大的帮助。
腰椎穿刺常见的并发症有穿刺部位疼痛、出血，腰穿后头痛，马尾神经损伤。穿刺部位出血，通过局部压迫数分钟即可止血；穿刺部位的疼痛以及穿刺后头痛，一周就可以好转；马尾神经损伤一个月可以好转。